质粒DNA提取一般用沸水浴法和碱裂解法,现在一般都采用碱裂解法,并有试剂盒可用。它主要是将细胞内的环状质粒提取出来,一般需要用SDS裂解,RNA酶降解,然后过柱,再进行洗脱.过程比较简单。
而基因组DNA提取则较为复杂,也需要用SDS裂解和RND酶降解,但降解时间较长,同时对有些革兰氏阳性细菌还要进行溶菌酶处理,最后用氯仿-苯酚进行除蛋白,这一步重复进行多次,在用氯仿除去多余的苯酚,用乙醇清洗烘干后溶于TE缓冲液中。整个过程比提质粒更复杂,耗时也更长。
做细胞转染后仅六个小时,发现培养皿整个的非常浑浊,肉眼看有点像有白色沉淀,镜下已经看不到细胞,非常污浊,看不清楚。请教这是什么东西啊,我估计是我的质粒污染了,如何去除质粒中的污染啊,转染之前我用乙醇沉淀过的。请大家帮忙,谢了!质粒污染就是蛋白质和RNA还有基因组DNA的污染。蛋白质污染可以用酚氯仿重新来抽提,RNA污染可以用RNA酶去除RNA,基因组 DNA污染可以在质粒抽提时注意点就可以避免了,不好去除基因组DNA,要么就胶回收来去除DNA.如果时手工法提的质粒,建议换试剂盒来提,这些都可以避免的。1.估计培养皿的"浑浊"现象是细菌.
2.如果是质粒污染的话,电泳就能检测出来.
3.把你提取的质粒过柱子就可以啦.混浊是细菌污染,菌长的多的时候摇晃一下培养皿,会看到类似白烟的东西,镜下一看都是细菌。
一般质粒提取最后的时候注意一下,用灭菌水和无菌的EP管,管口过火,质粒提取后如果要检样,用无菌枪头。转染完成之后,换培养液的时候要加双抗的培养液。
注意这些一般不会有问题。
solution1就是提供一个裂解菌体的溶液~有一些蛋白质变性剂去垢剂葡萄糖做调解渗透压的作用~
solution2就是碱性的致使核酸(基因组DNA加质粒DNA)发生变性的溶液~solution3就是用来中和2的碱性的溶液~使得质粒可以复性而基因组DNA则不能~所以经离心就可以把质粒分离开来了~
大提质粒和小提质粒的基本原理是一样的,都是通过一定的方法(如加碱裂解)使在细菌内大量扩增的质粒释放出来,然后经过去蛋白去RNA等一系列步骤纯化DNA,最终将DNA提取出来。
1、利用氯霉素抑制染色体的复制,而不抑制质粒的复制这一特点,在低拷贝质粒(如pUC19)的培养过程中添加氯霉素可以大大提高得率。
2、RNA 的去除,首先是使用 RNase 消化。在溶液 I 中加入高浓度的 RNase A (100ug/ml),或者用含 25ug RNase A/ml TE 溶解抽提好的质粒,都可以降低 RNA 残留,但都不能彻底去除。
3、蛋白质的去除,主要是靠不溶解的 K-SDS-蛋白质复合物的形成。虽然将中和后的体系置于 4C 一段时间,可以形成更多的该不溶复合物,从而使蛋白质残留更少,但实践证明这样做并不是必须的,除非是大量抽提。 首先,质粒的提取可分为质粒小提、质粒中提、质粒大提。目前大多数实验室都选用试剂盒进行提取,可以根据实验的不同需求,选择相应的试剂盒。 质粒小提主要用于用于大肠杆菌中质粒DNA的小量提取,获得的质粒可以用于常规的载体构建,一般适用于5ml以下菌液。 而质粒中提,在小提的基础上可以进一步去除菌液中的内毒素,获得的质粒可以用于细胞转染,常规需要菌液量为10-15ml。质粒大提与中提方法相同,可一次抽提100ml-300ml菌液获得大量质粒。
不是260/230,是260/280,如果比值是1.7的话,那说明样品里面还有蛋白,有可能是菌体量太大,也可能和试剂盒质量有关系,一般质粒小抽的试剂盒产量都不是很高的,浓度有100ng/ul就不错了。
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